Las líneas de investigación se han enfocado en el análisis de secuenciación con principal interés en las áreas de genómica de patógenos, análisis comparativo, filogenético, detección de genes asociados a factores de patogenicidad y de resistencia a antibióticos; ecología de poblaciones de bacterias mediante el análisis del gen 16S rRNA, metagenómica “shotgun”, y desarrollo de herramientas bioinformáticas.

• Licenciatura en Biología, Instituto Tecnológico de Cd. Victoria, 2002.
• Maestría en Oceanografía Costera, Universidad Autónoma de Baja California, 2007.
• Doctor en Biotecnología Marina, CICESE, 2015.

Los trabajos científicos publicados se han enfocado en la descripción genómica de bacterias patógenas, como V. parahaemolyticus, V. vulnificus, E. coli y P. aeruginosa, con principal interés en el estudio de genes implicados en el proceso de infección, genes de resistencia a antibióticos, y descripción genómica implementando análisis bioinformáticos. Análisis de la estructura de poblaciones de microorganismos en ecosistemas acuáticos mediante secuenciación del gen 16S rRNA.

Una de las áreas de mayor interés científico es el estudio de patógenos implementando métodos de análisis bioinformático. Con el fin de realizar análisis a gran escala, se ha enfocado en la implementación y desarrollo de herramientas bioinformáticas en diferentes lenguajes de programación, como R, Perl y Shell. Actualmente se encuentra en el proceso de desarrollo de la paquetería “gcluster” en R, la cual permite el análisis comparativo de múltiples genomas, detectar genes, generar arboles filogenéticos, y análisis comparativos.

• Guerrero, A., Gómez Gil Rodríguez, B., Wong-Chang, I., & Lizárraga-Partida, M. L. (2015). Genetic characterization of Vibrio vulnificus strains isolated from oyster samples in Mexico. International journal of environmental health research, 25(6), 614–627. doi: 10.1080/09603123.2014.1003038
• Guerrero, A., Lizárraga-Partida, M. L., Gómez Gil Rodríguez, B., Licea-Navarro, A. F., Revilla-Castellanos, V. J., Wong-Chang, I., & González-Sánchez, R. (2017). Genetic Analysis of Vibrio parahaemolyticus O3:K6 Strains That Have Been Isolated in Mexico Since 1998. PloS one, 12(1), e0169722. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0169722.
• Moreno-Ulloa A, Sicairos Diaz V, Tejeda-Mora JA, Macias Contreras MI, Díaz Castillo F, Guerrero A, Gonzales Sanchez R, Vazquez Duhalt R, Licea-Navarro A. 2019. Metabolic and metagenomic profiling of hydrocarbon-degrading microorganisms obtained from the deep biosphere of the Gulf of México; bioRxiv 606806; doi: https://doi.org/10.1101/606806
• Guerrero, A., Licea-Navarro, A. F., González-Sánchez, R., & Lizárraga-Partida, M. L. (2019). Whole-genome comparison between reference sequences and oyster Vibrio vulnificus C-genotype strains. PloS one, 14(7), e0220385. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0220385
• Moreno-Ulloa ASicairos Diaz V, Tejeda-Mora JA Macias Contreras MI, Castillo FD, Guerrero A, Gonzalez-Sanchez R, Mendoza-Porras O, Vazquez Duhalt R, Licea-Navarro A. 2020.Chemical Profiling Provides Insights into the Metabolic Machinery of Hydrocarbon-Degrading Deep-Sea Microbes. mSystems5:10.1128/msystems.00824-20. https://doi.org/10.1128/msystems.00824-20
• Guerrero, A., Gomez-Gil, B. & Lizarraga-Partida, M.L. Genomic stability among O3:K6 V. parahaemolyticus pandemic strains isolated between 1996 to 2012 in American countries. BMC Genom Data 22, 38 (2021). https://doi.org/10.1186/s12863-021-00985-0
• Guerrero A., A. F. Licea, M. L. Lizárraga-Partida. Metagenomic analysis among water masses and sediments from the Southern Gulf of Mexico. Frontiers in Marine Science, 9. Doi:10.3389/fmars.2022.1020136.
• Mandujano, A., Cortés-Espinosa, D. V., Vásquez-Villanueva, J., Guel, P., Rivera, G., Juárez-Rendón, K., Cruz-Pulido, W. L., Aguilera-Arreola, G., Guerrero, A., Bocanegra-García, V., Martínez-Vázquez, A. V. (2023). Extended-Spectrum β-Lactamase-Producing Escherichia coli Isolated from Food-Producing Animals in Tamaulipas, Mexico. Antibiotics (Basel, Switzerland), 12(6), 1010. https://doi.org/10.3390/antibiotics12061010.
• Hernández-Melgar, A. G., Guerrero, A., & Moreno-Ulloa, A. (2024). Chronic Exposure to Petroleum-Derived Hydrocarbons Alters Human Skin Microbiome and Metabolome Profiles: A Pilot Study. Journal of proteome research. https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.4c00256.

• José Antonio Mandujano Hernández (maestría, 2020), quien desarrolló la tesis “Caracterización de Cepas de Escherichia coli Productoras de -Lactamasas de Espectro Extendido (BLEE) en Carne del Noreste de Tamaulipas”. Tesis desarrollada en el Centro de Biotecnología Genómica del Instituto Politécnico Nacional (CBG-IPN).
• Jessica Itzayana Licea Herrera (doctorado, en proceso), con la tesis “Diversidad Genética y Resistencia Antimicrobiana de Pseudomonas aeruginosa en Ambiente Agrícola De Tamaulipas”, la tesis está siendo desarrollada en el Centro de Biotecnología Genómica del Instituto Politécnico Nacional (CBG-IPN).

• Seminario de Investigación I (Titular)
• Biología Computacional (Colaborador)

• Implementación de redes de observación oceanográficas (físicas, geoquímicas, ecológicas) para la generación de escenarios ante posibles contingencias relacionadas a la exploración y producción de hidrocarburos en aguas profundas del Golfo de México.