claudia villicaña
Dra. María Claudia Villicaña Torres

Investigadora por México – Conahcyt
SNI I

Bacteriófagos Bacterias patógenas Profagos Ómicas Enzimas recombinantes AgroquímicosBionoculantes

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Coordinación

Ciencia y Tecnología de Productos Agrícolas de Zonas Tropicales y Subtropicales

Teléfono

+52 (667) 480 6950

Correo electrónico

maria.villicana@ciad.mx

  • Aislamiento y Caracterización de fagos de bacterias patógenas de importancia en salud y agricultura.
  • Genómica funcional y transcriptómica de microorganismos.
  • Clonación y Caracterización de enzimas codificadas por fagos con potencial biotecnológico.
  • Caracterización Genómica, transcriptómica y funcional de bacterias degradadoras de agroquímicos y con propiedades promotoras del crecimiento en plantas.
  • Licenciatura en Biología Marina por la Universidad Autónoma de Baja California Sur (2004).
  • Maestría en Ciencias por el Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. (2007).
  • Doctorado en Ciencias Bioquímicas por la Universidad Nacional Autónoma de México (2013).
  • Análisis de los Mecanismos moleculares asociados a la degradación de agroquímicos y plaguicidas.
  • Generación de inoculantes microbianos aplicados a procesos de biorremediación y como biofertilizantes.
  • Diseño de formulaciones de bacteriófagos como antimicrobianos con aplicación en el área de salud y ciencias agropecuarias.
  • Análisis de la diversidad y la Biología de bacteriófagos líticos y temperados aislados de diferentes fuentes ambientales.
  • Caracterización de enzimas provenientes de fagos con novedosas aplicaciones biotecnológicas.
  • Salazar-Gutiérez, et al. (2023). Transcriptomic Analysis Reveals the Response Mechanisms of Bell Pepper (Capsicum annuum)
  • Grimaldi-Olivas, et al. (2023). Transcriptomic analysis of bell pepper (Capsicum annuum L.) revealing key mechanisms in response
  • Morales-Merida, et al. (2023) RVE1, DBB1b and COL2 Transcription Factors are Responsive to Combined Stress by UV-B
  • Lafrance, et al. (2023). Response Surface Methodology for Optimization of Multiplex-PCR Protocols for Detection of TYLCV,
  • Martínez-Gallardo, et al. (2023). Current knowledge in the use of bacteriophages to combat infections caused by Pseudomonas
  • Criollo-Mendoza, et al. (2022). Cytotoxic Activity of Polyphenol Extracts from Three Oregano Species: Hedeoma patens, Lippia
  • Lafrance, et al. (2021). Optimization of PCR-based TYLCV molecular markers by response surface methodology. Gene, 785,
  • Morales-Merida, et al. (2021) Transcriptomic analysis of differentially expressed genes in response to combined stress by UV-
  • Amarillas, et al. (2021). The complete genome and comparative analysis of the phage phiC120 infecting multidrug-resistant
  • León-Félix, et al. (2021). The impact of quorum sensing on the modulation of phage-host interactions. Journal of bacteriology,
  • León-Chan, et al. (2020) Differential gene expression of anthocyanin biosynthetic genes under low temperature and ultraviolet-
  • Villicaña, et al. (2019). Occurrence and Abundance of Pathogenic Vibrio Species in Raw Oysters at Retail Seafood Markets
  • Rojas, et al. (2019). Involvement of OpsLTP1 from Opuntia streptacantha in abiotic stress adaptation and lipid metabolism.
  • Rodas-Junco, et al, (2017). Dental Pulp Stem Cells: Current Advances in Isolation, Expansion and Preservation. Tissue Engineering
  • Villicaña, et al. (2016) Antiporter NHX2 is differentially induced in Mesembryanthemum crystallinum natural genetic variant
  • Villicaña, et al. (2014). The basal transcription machinery as a target for cancer therapy. Cancer Cell International, 14(1),
  • Villicaña, et al. (2013). The genetic depletion or the triptolide inhibition of TFIIH in p53-deficient cells induces a JNK-dependent
  • Herrera-Cruz, et al. (2012). Physical and functional interactions between Drosophila homologue of Swc6/p18Hamlet subunit
  • Diseño de un consorcio sintético bacteriano con capacidad degradadora de glifosato y AMPA con aplicación potencial en procesos de biorremediación
  • Aislamiento y caracterización de bacteriófagos líticos y temperados de Clavibacter michiganensis.

POSGRADO

  • Alejandro Payán García, Maestría, Caracterización genómica y funcional de bacterias
    degradadoras de glifosato y AMPA con potencial en biorremediación (en proceso).
  • Alexandra Guzmán López, Maestría, Genómica comparativa de cepas de Clavibacte michiganensis aisladas de México (en proceso).
  • Lucía Margarita Rubí Rangel, Doctorado, Papel de los bacteriófagos en la biología de Clavibacter michiganensis (en proceso)

LICENCIATURA

  • Karla Selena Osuna Flores (en proceso)
  • Evaluación de la capacidad degradadora de glifosato y ácido aminometilfosfónico (AMPA) de bacterias aisladas de suelo agrícola con potencial en biorremediación. Tesis de Licenciatura. Valeria León Medina. 2023.
  • Aislamiento y caracterización de bacterias degradadoras de ácido aminometilfosfónico (AMPA) con potencial en biorremediación de suelos  expuestos a glifosato. Tesis de Licenciatura. Brenda Kirey Figueroa Iriarte. 2023.
  • Aislamiento y caracterización de bacterias degradadoras de glifosato aisladas de suelos agrícolas con potencial en biorremediación. Tesis de Licenciatura. Solangel Itzel Machado Valdez. 2023.
  • Extracción de proteínas en hojas y raíz de pimiento morrón (Capsicum annuum L.) y su análisis por electroforesis en una y dos dimensiones. Tesis de Licenciatura. René Rodríguez Sepúlveda. 2019.
  • Evaluación de marcadores moleculares asociados a la resistencia contra Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici en variedades comerciales de tomate. Tesis de Licenciatura. Martín Israel López Valenzuela. 2020

Titular

  • Biología y Ecología de Bacteriófagos
  • Biología Celular

Colaborador

  • Biología Molecular
  • Técnicas Básicas de Biología Molecular
  • Evaluación de la expresión génica
  • Miembro de la Sociedad Mexicana de Ciencias Hortícolas (SOMECH) 2023-2024.
  • Sistema Nacional de Investigadores Nivel I 2021-2025.
  • Evaluador acreditado RCEA-02-37798-2016
  • Asesora e Integrante del Directorio de Verano Delfín( desde 2021)
  • Divulgador de Ciencia Titular de Red Estatal de Divulgadores de la Ciencia y la Tecnología (RED-C 2023-202
  • Miembro honorífico del Sistema Sinaloense de Investigadores y Tecnólogos (SSIT) 2022-2024.
  • Evaluador de solicitudes en convocatorias CONAHCYT
  • Evaluador de ingreso al SSIT
  • Revisor en revistas científicas Heliyon, Frontiers in Microbiology, Viruses, Current Issues in Molecular Biology, Microorganisms
  • Socio numerario de la Sociedad Mexicana de Biotecnología y Bioingeniería 2021-2022.
  • Miembro de la American Society of Plant Biologist Section Mexico 2020-2023
Líneas de Investigación
  • Aislamiento y Caracterización de fagos de bacterias patógenas de importancia en salud y agricultura.
  • Genómica funcional y transcriptómica de microorganismos.
  • Clonación y Caracterización de enzimas codificadas por fagos con potencial biotecnológico.
  • Caracterización Genómica, transcriptómica y funcional de bacterias degradadoras de agroquímicos y con propiedades promotoras del crecimiento en plantas.
Formación profesional
  • Licenciatura en Biología Marina por la Universidad Autónoma de Baja California Sur (2004).
  • Maestría en Ciencias por el Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. (2007).
  • Doctorado en Ciencias Bioquímicas por la Universidad Nacional Autónoma de México (2013).
Área de Interés
  • Análisis de los Mecanismos moleculares asociados a la degradación de agroquímicos y plaguicidas.
  • Generación de inoculantes microbianos aplicados a procesos de biorremediación y como biofertilizantes.
  • Diseño de formulaciones de bacteriófagos como antimicrobianos con aplicación en el área de salud y ciencias agropecuarias.
  • Análisis de la diversidad y la Biología de bacteriófagos líticos y temperados aislados de diferentes fuentes ambientales.
  • Caracterización de enzimas provenientes de fagos con novedosas aplicaciones biotecnológicas.
Publicaciones seleccionadas
  • Salazar-Gutiérez, et al. (2023). Transcriptomic Analysis Reveals the Response Mechanisms of Bell Pepper (Capsicum annuum)
  • Grimaldi-Olivas, et al. (2023). Transcriptomic analysis of bell pepper (Capsicum annuum L.) revealing key mechanisms in response
  • Morales-Merida, et al. (2023) RVE1, DBB1b and COL2 Transcription Factors are Responsive to Combined Stress by UV-B
  • Lafrance, et al. (2023). Response Surface Methodology for Optimization of Multiplex-PCR Protocols for Detection of TYLCV,
  • Martínez-Gallardo, et al. (2023). Current knowledge in the use of bacteriophages to combat infections caused by Pseudomonas
  • Criollo-Mendoza, et al. (2022). Cytotoxic Activity of Polyphenol Extracts from Three Oregano Species: Hedeoma patens, Lippia
  • Lafrance, et al. (2021). Optimization of PCR-based TYLCV molecular markers by response surface methodology. Gene, 785,
  • Morales-Merida, et al. (2021) Transcriptomic analysis of differentially expressed genes in response to combined stress by UV-
  • Amarillas, et al. (2021). The complete genome and comparative analysis of the phage phiC120 infecting multidrug-resistant
  • León-Félix, et al. (2021). The impact of quorum sensing on the modulation of phage-host interactions. Journal of bacteriology,
  • León-Chan, et al. (2020) Differential gene expression of anthocyanin biosynthetic genes under low temperature and ultraviolet-
  • Villicaña, et al. (2019). Occurrence and Abundance of Pathogenic Vibrio Species in Raw Oysters at Retail Seafood Markets
  • Rojas, et al. (2019). Involvement of OpsLTP1 from Opuntia streptacantha in abiotic stress adaptation and lipid metabolism.
  • Rodas-Junco, et al, (2017). Dental Pulp Stem Cells: Current Advances in Isolation, Expansion and Preservation. Tissue Engineering
  • Villicaña, et al. (2016) Antiporter NHX2 is differentially induced in Mesembryanthemum crystallinum natural genetic variant
  • Villicaña, et al. (2014). The basal transcription machinery as a target for cancer therapy. Cancer Cell International, 14(1),
  • Villicaña, et al. (2013). The genetic depletion or the triptolide inhibition of TFIIH in p53-deficient cells induces a JNK-dependent
  • Herrera-Cruz, et al. (2012). Physical and functional interactions between Drosophila homologue of Swc6/p18Hamlet subunit
Proyectos vigentes
  • Diseño de un consorcio sintético bacteriano con capacidad degradadora de glifosato y AMPA con aplicación potencial en procesos de biorremediación
  • Aislamiento y caracterización de bacteriófagos líticos y temperados de Clavibacter michiganensis.
Dirección de tesis

POSGRADO

  • Alejandro Payán García, Maestría, Caracterización genómica y funcional de bacterias
    degradadoras de glifosato y AMPA con potencial en biorremediación (en proceso).
  • Alexandra Guzmán López, Maestría, Genómica comparativa de cepas de Clavibacte michiganensis aisladas de México (en proceso).
  • Lucía Margarita Rubí Rangel, Doctorado, Papel de los bacteriófagos en la biología de Clavibacter michiganensis (en proceso)

LICENCIATURA

  • Karla Selena Osuna Flores (en proceso)
  • Evaluación de la capacidad degradadora de glifosato y ácido aminometilfosfónico (AMPA) de bacterias aisladas de suelo agrícola con potencial en biorremediación. Tesis de Licenciatura. Valeria León Medina. 2023.
  • Aislamiento y caracterización de bacterias degradadoras de ácido aminometilfosfónico (AMPA) con potencial en biorremediación de suelos  expuestos a glifosato. Tesis de Licenciatura. Brenda Kirey Figueroa Iriarte. 2023.
  • Aislamiento y caracterización de bacterias degradadoras de glifosato aisladas de suelos agrícolas con potencial en biorremediación. Tesis de Licenciatura. Solangel Itzel Machado Valdez. 2023.
  • Extracción de proteínas en hojas y raíz de pimiento morrón (Capsicum annuum L.) y su análisis por electroforesis en una y dos dimensiones. Tesis de Licenciatura. René Rodríguez Sepúlveda. 2019.
  • Evaluación de marcadores moleculares asociados a la resistencia contra Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici en variedades comerciales de tomate. Tesis de Licenciatura. Martín Israel López Valenzuela. 2020
Docencia

Titular

  • Biología y Ecología de Bacteriófagos
  • Biología Celular

Colaborador

  • Biología Molecular
  • Técnicas Básicas de Biología Molecular
  • Evaluación de la expresión génica
Premios y distinciones
  • Miembro de la Sociedad Mexicana de Ciencias Hortícolas (SOMECH) 2023-2024.
  • Sistema Nacional de Investigadores Nivel I 2021-2025.
  • Evaluador acreditado RCEA-02-37798-2016
  • Asesora e Integrante del Directorio de Verano Delfín( desde 2021)
  • Divulgador de Ciencia Titular de Red Estatal de Divulgadores de la Ciencia y la Tecnología (RED-C 2023-202
  • Miembro honorífico del Sistema Sinaloense de Investigadores y Tecnólogos (SSIT) 2022-2024.
Comisiones externas
  • Evaluador de solicitudes en convocatorias CONAHCYT
  • Evaluador de ingreso al SSIT
  • Revisor en revistas científicas Heliyon, Frontiers in Microbiology, Viruses, Current Issues in Molecular Biology, Microorganisms
Redes de investigación
  • Socio numerario de la Sociedad Mexicana de Biotecnología y Bioingeniería 2021-2022.
  • Miembro de la American Society of Plant Biologist Section Mexico 2020-2023
Grupos de investigación
Laboratorios
  • Biología Molecular
  • Genómica Funcional
Líneas de Generación y Aplicación del Conocimiento
  • Biología molecular
  • Microbiología ambiental
  • Ciencias ómicas
  • Ingeniería genética

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